Таблицы Inode сжимаются со временем, вызывая проблемы с Rsync / Inode


12

Мы настраиваем систему Linux (она работает на Amazon AWS, CentOS-подобной системе, хотя мы не совсем уверены в том, что настройки выполнены на ней) с хранилищем объемом 4 ТБ в качестве тома XFS через LVM (в конечном счете, для обслуживания через NFS4, но это еще не используется), и мы находимся в процессе использования rsync для синхронизации файлов с нашего производственного NFS-сервера на том XFS (т. е. мы rsync из источника через NFS на локально смонтированный том LVM на основе XFS). Тем не менее, мы заметили, что в какой-то момент в середине rsync начал становиться все более вялым (пропускная способность резко снижалась), и средняя загрузка, и потребление памяти возросли в значительной степени (и у CPU очень большая доля в iowait). В конце концов я перезагрузил систему XFS, и система, по-видимому, вернулась к нормальной работе с более нормальной производительностью rsync, по крайней мере, в течение последних 24 часов.

Мы проверили графики мониторинга munin и не заметили ничего очевидного, но обнаружили, что метрики "Размер таблицы Inode" и "open inode" (проверили реализацию плагина munin, которая указывает на значения, считываемые из / proc / sys / fs / inode-nr) продолжал уменьшаться с течением времени. Незадолго до того, как мы наблюдали зависание rsync, мы заметили, что обе метрики снизились до нескольких тысяч из нескольких сотен тысяч (наши серверы, не относящиеся к XFS, большую часть времени остаются примерно на 500 тысячах и не показывают монотонную тенденцию к снижению в течение продолжительных периодов времени ), и мы наблюдали журналы из ядра, подобные этим:

ip-XX-XXX-XXX-XXX логин: [395850.680006] hrtimer: прерывание заняло 20000573 нс
18 сентября 17:19:58 ip-XX-XXX-XXX-XXX ядро: [395850.680006] hrtimer: прерывание заняло 20000573 нс
[400921.660046] ИНФОРМАЦИЯ: rsync задачи: 7919 заблокирован более 120 секунд.
[400921.660066] «echo 0> / proc / sys / kernel / hung_task_timeout_secs» отключает это сообщение.
[400921.660077] rsync D ffff880002fe4240 0 7919 7918 0x00000000
[400921.660093] ffff8800683e5638 0000000000000282 ffff880000000000 0000000000014240
[400921.660131] ffff8800683e5fd8 0000000000014240 ffff8800683e5fd8 ffff88000726da40
[400921.660153] 0000000000014240 0000000000014240 ffff8800683e5fd8 0000000000014240
[400921.660176] Отслеживание вызовов:
[400921.660202] [] schedule_timeout + 0x1fd / 0x270
[400921.660220] []? pvclock_clocksource_read + 0x58 / 0xd0
[400921.660234] []? __raw_callee_save_xen_irq_enable + 0x11 / 0x26
[400921.660247] [] __down + 0x76 / 0xc0
[400921.660262] [] вниз + 0x3b / 0x50
[400921.660274] []? _raw_spin_unlock_irqrestore + 0x19 / 0x20
[400921.660314] [] xfs_buf_lock + 0x2b / 0x80 [xfs]
[400921.660338] [] _xfs_buf_find + 0x139 / 0x230 [xfs]
[400921.660360] [] xfs_buf_get + 0x5b / 0x160 [xfs]
[400921.660378] [] xfs_buf_read + 0x13 / 0xa0 [xfs]
[400921.660401] [] xfs_trans_read_buf + 0x197 / 0x2c0 [xfs]
[400921.660422] [] xfs_read_agi + 0x6f / 0x100 [xfs]
[400921.660443] [] xfs_ialloc_read_agi + 0x29 / 0x90 [xfs]
[400921.660467] [] xfs_ialloc_ag_select + 0x12b / 0x280 [xfs]
[400921.660485] [] xfs_dialloc + 0x3c7 / 0x870 [xfs]
[400921.660500] []? pvclock_clocksource_read + 0x58 / 0xd0
[400921.660509] []? __raw_callee_save_xen_restore_fl + 0x11 / 0x1e
[400921.660531] [] xfs_ialloc + 0x60 / 0x6a0 [xfs]
[400921.660550] []? xlog_grant_log_space + 0x39c / 0x3f0 [xfs]
[400921.660566] []? xen_spin_lock + 0xA5 / 0x110
[400921.660583] [] xfs_dir_ialloc + 0x7d / 0x2d0 [xfs]
[400921.660606] []? xfs_log_reserve + 0xe2 / 0xf0 [xfs]
[400921.660623] [] xfs_create + 0x3f7 / 0x600 [xfs]
[400921.660638] []? __raw_callee_save_xen_restore_fl + 0x11 / 0x1e
[400921.660655] [] xfs_vn_mknod + 0xa2 / 0x1b0 [xfs]
[400921.660678] [] xfs_vn_create + 0xb / 0x10 [xfs]
[400921.660689] [] vfs_create + 0xa7 / 0xd0
[400921.660701] [] do_last + 0x529 / 0x650
[400921.660714] []? get_empty_filp + 0x75 / 0x170
[400921.660728] [] do_filp_open + 0x213 / 0x670
[400921.660744] []? xen_spin_lock + 0xA5 / 0x110
[400921.660753] []? __raw_callee_save_xen_restore_fl + 0x11 / 0x1e
[400921.660769] []? alloc_fd + 0x102 / 0x150
[400921.660780] [] do_sys_open + 0x64 / 0x130
[400921.660792] []? __raw_callee_save_xen_irq_disable + 0x11 / 0x1e
[400921.660804] [] sys_open + 0x1b / 0x20
[400921.660815] [] system_call_fastpath + 0x16 / 0x1b

Мы также наблюдали резкое увеличение количества операций поиска в исходной NFS, когда это произошло, которая ранее оставалась стабильной до того, как мы начали испытывать упомянутую проблему rsync.

Мы не наблюдали аналогичного поведения на наших объемах производства, основанных на ext3, и на самом деле они были с еще большими объемами. За исключением различий в файловой системе, файловые серверы находятся на аналогичном классе компьютеров и настроены аналогичным образом. Поскольку мы обнаружили, что показатели таблиц inode на сервере XFS только сейчас все еще имеют тенденцию к снижению, аналогичную нашему более раннему наблюдению, хотя мы только что перезагрузили его вчера, я обеспокоен тем, что та же самая проблема скоро будет преследовать нас снова и, вероятно, отразит некоторые проблемы с нашей установкой, ядром или чем-то еще.

Когда мы это испытывали, мы работали с томами XFS, смонтированными на inode64, на компьютерах с архитектурой x86_64 Сейчас мы скопировали около 1,3 ТБ данных на том XFS, емкость которого составляет приблизительно 4 ТБ, и мы должны иметь около 3 ТБ данных в томе, если они полностью скопированы. Том был создан заново, поэтому был смонтирован на inode64 с самого начала, когда внутри не было данных, поэтому файловая система должна быть чистой и равномерно распределенной.

Любое понимание того, что может быть причиной?

(PS на самом деле мы начали видеть это еще несколько часов назад!)


Это похоже на поведение, которое вы бы увидели, когда «переломный момент» для массива был замечен под большой нагрузкой. Если кэш VFS разрушен или число операций резко увеличивается и т. Д. Можете ли вы собрать больше показателей о количестве операций чтения и записи в секунду за период и статистических данных / proc / meminfo о буферах кэша?
полином

Возможно ли вывести NFS из уравнения? Как rsync + ssh или rsync + rsh?
AndreasM

Ответы:



1

polynomial и AndreasM сказали то, что естественно приходит на ум: похоже, это бьющая ситуация, вам не хватило памяти.

Rsync собирает список файлов для передачи в 1-й проход, и 1 / обход большой иерархии по NFS медленен (локальный lstat()перевод как удаленный NFS getattrмедленен и не кэшируется, поскольку вы проходите только один раз), 2 / эта проблема зависит от количество inode (использовать df -i), а не общее количество данных для передачи.

Обратите внимание, что использование rsync -H|--hard-linksеще дороже, rsync должен создать полные хеш-таблицы всех inode, чтобы найти дубликаты.

Попробуйте использовать rsync прямо из файловой системы, экспортируемой NFS-сервером, в обход NFS. В зависимости от вашей задержки NFS, это может быть хорошим стимулом.

В некоторых крайних случаях, когда обход большой коллекции inode на самом деле обходился дороже, чем простое копирование данных, я использовал что-то вроде ssh source 'tar -cC /path/to/src .' | tar -xC /path/to/destпростой потоковой копии с постоянным использованием памяти. В зависимости от настроек вашего ЦП + сети добавление сжатия может ускорить всю операцию - или нет (добавьте -zоба вызова tar).

Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.