Autoruns и Process Explorer от Sysinternals (теперь принадлежащие MS) - ваши лучшие друзья. 1-2 заражения, которые я вижу за неделю, когда пользователь открыл вложение или посетил страницу, которую не должен был иметь, а (последняя версия!) AV не полностью заблокировала его, обычно можно очистить в 30 минут работы только с этими двумя утилитами. Они довольно просты, и после первых нескольких очисток вы поймете, что знаете, что нужно убить / удалить, чтобы избавиться от вредоносного ПО.
Тем не менее, время от времени вы сталкиваетесь с кусочком вредоносного программного обеспечения, которое не написано идиотом, поэтому, если вы не можете добиться успеха через 30 минут, пришло время для полной очистки / перезагрузки.
Имейте в виду, это больше подходит для малого и среднего бизнеса, где оборудование не стандартизировано. Если у вас есть образ системы и резервные копии файлов пользователя, быстрее будет стереть / перезагрузить при первых признаках заражения.