Ответы:
Смонтируйте VMDK с помощью утилиты VMware Disk Mount, затем скопируйте нужный файл и размонтируйте его.
Смотрите эту страницу: http://www.vladan.fr/mounting-your-vmdk-disks-directly-to-your-windows-box-how-to/
7ZIP может открывать и извлекать файлы VMDK. Вы можете попробовать его версию для командной строки.
Используйте 7zip с полным извлечением пути к папке:
7z x -o<destination-folder> box-disk1.vmdk