Преобразование numpy dtypes в нативные типы Python


238

Если у меня есть пустой тип dtype, как мне автоматически преобразовать его в ближайший тип данных python? Например,

numpy.float32 -> "python float"
numpy.float64 -> "python float"
numpy.uint32  -> "python int"
numpy.int16   -> "python int"

Я мог бы попытаться придумать отображение всех этих случаев, но предоставляет ли numpy какой-то автоматический способ преобразования своих dtypes в наиболее близкие возможные нативные типы python? Это отображение не должно быть исчерпывающим, но оно должно преобразовывать общие dtypes, которые имеют близкий аналог python. Я думаю, что это уже происходит где-то в NumPy.

Ответы:


325

Используйте val.item()для преобразования большинства значений NumPy в собственный тип Python:

import numpy as np

# for example, numpy.float32 -> python float
val = np.float32(0)
pyval = val.item()
print(type(pyval))         # <class 'float'>

# and similar...
type(np.float64(0).item()) # <class 'float'>
type(np.uint32(0).item())  # <class 'long'>
type(np.int16(0).item())   # <class 'int'>
type(np.cfloat(0).item())  # <class 'complex'>
type(np.datetime64(0, 'D').item())  # <class 'datetime.date'>
type(np.datetime64('2001-01-01 00:00:00').item())  # <class 'datetime.datetime'>
type(np.timedelta64(0, 'D').item()) # <class 'datetime.timedelta'>
...

(Другой способ np.asscalar(val), однако, он устарел, начиная с NumPy 1.16).


Для любопытных, чтобы построить таблицу преобразований скалярных массивов NumPy для вашей системы:

for name in dir(np):
    obj = getattr(np, name)
    if hasattr(obj, 'dtype'):
        try:
            if 'time' in name:
                npn = obj(0, 'D')
            else:
                npn = obj(0)
            nat = npn.item()
            print('{0} ({1!r}) -> {2}'.format(name, npn.dtype.char, type(nat)))
        except:
            pass

Есть несколько типов Numpy , которые не имеют родной эквивалента Python на некоторых системах, в том числе: clongdouble, clongfloat, complex192, complex256, float128, longcomplex, longdoubleи longfloat. Они должны быть преобразованы в ближайший эквивалент NumPy перед использованием .item().


Я использую панд (0.23.0). По крайней мере, для этой версии np.str не имеет метода .item (), поэтому единственный способ, которым я видел, - это обернуть .item () внутри блока try.
— Роберт Лугг

3
@RobertLugg np.str- это не тип Numpy, то есть np.str is strпросто псевдоним стандартного типа Python. То же самое с np.float, np.int, np.bool, np.complex, и np.object. Типы Numpy имеют трейлинг _, например np.str_.
— Майк Т

Я понимаю. Таким образом, вопрос «было бы неплохо, если бы» я мог сделать, np.float64(0).item()а также np.float(0).item(). Другими словами, для случаев, когда известно, что делать, поддерживайте .item()метод, даже если он просто возвращает то же значение. Таким образом, я мог бы применить .item()к гораздо более грубым скалярам без специального кожуха. Как таковые, казалось бы, параллельные концепции отличаются из-за базовой реализации. Я полностью понимаю, почему это было сделано. Но это раздражает пользователя библиотеки.
— Роберт Лугг

45

я обнаружил, что смешал набор типов numpy и стандартный python. как все numy-типы происходят из numpy.generic, вот как вы можете конвертировать все в стандартные типы Python:

if isinstance(obj, numpy.generic):
    return numpy.asscalar(obj)

5
Как отмечается в принятом ответе , NumPy 1.16 устарел np.asscalar(). Зачем? Вероятно, без видимых на то причин. Несмотря на десятилетнюю относительную стабильность, API-интерфейс NumPy в настоящее время является нестабильной движущейся целью, требующей постоянного обслуживания от последующих приложений. По крайней мере, они оставили нам item()метод ... пока.
— Сесил Карри

метод asscalar обесценился начиная с v1.6 numpy
— Eswar

Вы можете легко заменить ответ на, if isinstance(o, numpy.generic): return o.item() raise TypeErrorи он снова превратится в неутешительный ответ: D
— Багги

19

Если вы хотите преобразовать (numpy.array ИЛИ numpy скаляр ИЛИ собственный тип ИЛИ numpy.darray) в собственный тип, вы можете просто сделать:

converted_value = getattr(value, "tolist", lambda: value)()

Tolist преобразует ваш скаляр или массив в нативный тип Python. Лямбда-функция по умолчанию заботится о случае, когда значение уже является нативным.


2
Самый чистый подход для смешанных типов (нативных и нативных), молодец! А для тех, кто задается вопросом, да, tolist просто возвращает одно значение (скаляр), когда вы вызываете его для одного значения, а не списка, как вы могли бы подумать. Стоит отметить, что проще написать лямбду, lambda: valueпоскольку мы не хотим никаких входных данных.
— fgblomqvist

getattr+ tolistкомбо не только универсальное, но даже векторизованное! (unlinke .item ())
— mirekphd

11

Как насчет:

In [51]: dict([(d, type(np.zeros(1,d).tolist()[0])) for d in (np.float32,np.float64,np.uint32, np.int16)])
Out[51]: 
{<type 'numpy.int16'>: <type 'int'>,
 <type 'numpy.uint32'>: <type 'long'>,
 <type 'numpy.float32'>: <type 'float'>,
 <type 'numpy.float64'>: <type 'float'>}

1
Я упоминаю этот тип решения как возможность в конце моего вопроса. Но я ищу системное решение, а не жестко закодированное, которое охватывает только несколько случаев. Например, если numpy добавит больше dtypes в будущем, ваше решение сломается. Так что я не доволен этим решением.
— Конрадле

Число возможных dtypes не ограничено. Рассмотрим np.dtype('mint8')для любого положительного целого числа m. Не может быть исчерпывающего картирования. (Я также не верю, что для этого преобразования есть встроенная функция. Я могу ошибаться, но я так не думаю :))
— unutbu

2
Python отображает numpy dtypes на типы python, я не уверен как, но я бы хотел использовать любой метод, который они делают. Я думаю, что это должно произойти, чтобы разрешить, например, умножение (и другие операции) между типами numpy dtypes и python. Я предполагаю, что их метод не исчерпывающе отображает все возможные типы numpy, но, по крайней мере, наиболее распространенные, где это имеет смысл.
— Конрадле

Это не работает последовательно: >>> print([numpy.asscalar(x) for x in numpy.linspace(1.0, 0.0, 21)]) [1.0, 0.95, 0.9, 0.85, 0.8, 0.75, 0.7, 0.6499999999999999, 0.6, 0.55, 0.5, 0.44999999999999996, 0.3999999999999999, 0.35, 0.29999999999999993, 0.25, 0.19999999999999996, 0.1499999999999999, 0.09999999999999998, 0.04999999999999993, 0.0]как видите, не все значения были правильно преобразованы.
— Алекс Ф

Следуя моему предыдущему комментарию, странно, что этот работает, хотя я хотел бы, чтобы вам нужно было ставить раунд на нативный тип Python вместо нативного типа Numpy: >>> print([numpy.asscalar(round(x,2)) for x in numpy.linspace(1.0, 0.0, 21)]) [1.0, 0.95, 0.9, 0.85, 0.8, 0.75, 0.7, 0.65, 0.6, 0.55, 0.5, 0.45, 0.4, 0.35, 0.3, 0.25, 0.2, 0.15, 0.1, 0.05, 0.0]
— Alex F

9

tolist()это более общий подход для достижения этой цели. Он работает в любом примитивном dtype, а также в массивах или матрицах.

Я на самом деле не выдает список, если вызывается из примитивных типов:

numpy == 1.15.2

>>> import numpy as np

>>> np_float = np.float64(1.23)
>>> print(type(np_float), np_float)
<class 'numpy.float64'> 1.23

>>> listed_np_float = np_float.tolist()
>>> print(type(listed_np_float), listed_np_float)
<class 'float'> 1.23

>>> np_array = np.array([[1,2,3.], [4,5,6.]])
>>> print(type(np_array), np_array)
<class 'numpy.ndarray'> [[1. 2. 3.]
 [4. 5. 6.]]

>>> listed_np_array = np_array.tolist()
>>> print(type(listed_np_array), listed_np_array)
<class 'list'> [[1.0, 2.0, 3.0], [4.0, 5.0, 6.0]]


6

Я думаю, что вы можете просто написать общую функцию преобразования типа следующим образом:

import numpy as np

def get_type_convert(np_type):
   convert_type = type(np.zeros(1,np_type).tolist()[0])
   return (np_type, convert_type)

print get_type_convert(np.float32)
>> (<type 'numpy.float32'>, <type 'float'>)

print get_type_convert(np.float64)
>> (<type 'numpy.float64'>, <type 'float'>)

Это означает, что нет фиксированных списков, и ваш код будет масштабироваться с большим количеством типов.


Знаете ли вы, где находится исходный код для части метода tolist (), который отображает типы numpy в типы python? Я бросил быстрый взгляд, но не смог его найти.
— Конрадле

Это что-то вроде хака: я генерирую a numpy.ndarrayс нулем в нем, используя функцию zeros()вызова ndarrays tolist()функции для преобразования в нативные типы. Однажды в нативных типах я прошу тип вернуть его. tolist()является функциейndarray
— Мэтт Олкок

Да, я понимаю, что это работает для того, чего я хочу, и поэтому я принял ваше решение. Но мне интересно, как tolist () решает, к какому типу приписывать, и я не уверен, как найти источник.
— Конрадле

numpy.sourceforge.net/numdoc/HTML/numdoc.htm#pgfId-36588 - то, где функция задокументирована. Я подумал, что осмотр может помочь найти больше информации, но не радости. Следующим шагом я попытался клонировать github.com/numpy/numpy.git и запустить grep -r 'tolist' numpy. (все еще в процессе, NumPy является массивным!)
— Мэтт Олкок

3

Numpy содержит эту информацию в отображении, typeDictтак что вы можете сделать что-то вроде ниже:

>>> import __builtin__
>>> import numpy as np
>>> {v: k for k, v in np.typeDict.items() if k in dir(__builtin__)}
{numpy.object_: 'object',
 numpy.bool_: 'bool',
 numpy.string_: 'str',
 numpy.unicode_: 'unicode',
 numpy.int64: 'int',
 numpy.float64: 'float',
 numpy.complex128: 'complex'}

Если вы хотите фактические типы Python, а не их имена, вы можете сделать ::

>>> {v: getattr(__builtin__, k) for k, v in np.typeDict.items() if k in vars(__builtin__)}
{numpy.object_: object,
 numpy.bool_: bool,
 numpy.string_: str,
 numpy.unicode_: unicode,
 numpy.int64: int,
 numpy.float64: float,
 numpy.complex128: complex}

3

Извините, что опоздал на часть, но я смотрел на проблему преобразования только numpy.float64в обычный Python float. Я видел 3 способа сделать это:

  1. npValue.item()
  2. npValue.astype(float)
  3. float(npValue)

Вот соответствующие сроки от IPython:

In [1]: import numpy as np

In [2]: aa = np.random.uniform(0, 1, 1000000)

In [3]: %timeit map(float, aa)
10 loops, best of 3: 117 ms per loop

In [4]: %timeit map(lambda x: x.astype(float), aa)
1 loop, best of 3: 780 ms per loop

In [5]: %timeit map(lambda x: x.item(), aa)
1 loop, best of 3: 475 ms per loop

Похоже, float(npValue)кажется, гораздо быстрее.


1

Мой подход немного силен, но, похоже, подходит для всех случаев:

def type_np2py(dtype=None, arr=None):
    '''Return the closest python type for a given numpy dtype'''

    if ((dtype is None and arr is None) or
        (dtype is not None and arr is not None)):
        raise ValueError(
            "Provide either keyword argument `dtype` or `arr`: a numpy dtype or a numpy array.")

    if dtype is None:
        dtype = arr.dtype

    #1) Make a single-entry numpy array of the same dtype
    #2) force the array into a python 'object' dtype
    #3) the array entry should now be the closest python type
    single_entry = np.empty([1], dtype=dtype).astype(object)

    return type(single_entry[0])

Использование:

>>> type_np2py(int)
<class 'int'>

>>> type_np2py(np.int)
<class 'int'>

>>> type_np2py(str)
<class 'str'>

>>> type_np2py(arr=np.array(['hello']))
<class 'str'>

>>> type_np2py(arr=np.array([1,2,3]))
<class 'int'>

>>> type_np2py(arr=np.array([1.,2.,3.]))
<class 'float'>

Я вижу, что это по сути то же самое, что и ответ Мэтта Алкока.
— Саймон

1

Дополнительное замечание о скалярных массивах для тех, кто не нуждается в автоматическом преобразовании и знает numpy dtype значения:

Скалярные массивы отличаются от скалярных в Python, но по большей части они могут использоваться взаимозаменяемо (главное исключение для версий Python старше v2.x, где целочисленные скалярные массивы не могут выступать в качестве индексов для списков и кортежей). Есть некоторые исключения, например, когда код требует очень специфических атрибутов скаляра или когда он проверяет, является ли значение скаляром Python. Как правило, проблемы легко решаются путем явного преобразования скаляров массива в скаляры Python с использованием соответствующей функции типа Python (например, int, float, complex, str, unicode).

Источник

Таким образом, в большинстве случаев преобразование может вообще не понадобиться, и скалярный массив можно использовать напрямую. Эффект должен быть идентичным использованию скаляра Python:

>>> np.issubdtype(np.int64, int)
True
>>> np.int64(0) == 0
True
>>> np.issubdtype(np.float64, float)
True
>>> np.float64(1.1) == 1.1
True

Но если по какой-то причине необходимо явное преобразование, используйте соответствующую встроенную функцию Python. Как показано в другом ответе, он также быстрее скалярного item()метода массива .


0

Переведите весь ndarray вместо одного объекта данных:

def trans(data):
"""
translate numpy.int/float into python native data type
"""
result = []
for i in data.index:
    # i = data.index[0]
    d0 = data.iloc[i].values
    d = []
    for j in d0:
        if 'int' in str(type(j)):
            res = j.item() if 'item' in dir(j) else j
        elif 'float' in str(type(j)):
            res = j.item() if 'item' in dir(j) else j
        else:
            res = j
        d.append(res)
    d = tuple(d)
    result.append(d)
result = tuple(result)
return result

Тем не менее, это занимает несколько минут при обработке больших кадров данных. Я также ищу более эффективное решение. Надеюсь на лучший ответ.

Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.