Вы должны добавить его к осям. A Circleявляется подклассом класса an Artist, и метод axesимеет add_artistметод.
Вот пример этого:
import matplotlib.pyplot as plt
circle1 = plt.Circle((0, 0), 0.2, color='r')
circle2 = plt.Circle((0.5, 0.5), 0.2, color='blue')
circle3 = plt.Circle((1, 1), 0.2, color='g', clip_on=False)
fig, ax = plt.subplots() # note we must use plt.subplots, not plt.subplot
# (or if you have an existing figure)
# fig = plt.gcf()
# ax = fig.gca()
ax.add_artist(circle1)
ax.add_artist(circle2)
ax.add_artist(circle3)
fig.savefig('plotcircles.png')
Это приводит к следующему рисунку:

Первый круг находится в начале координат, но по умолчанию clip_onэто Trueтак, поэтому круг обрезается, когда он выходит за пределы axes. Третий (зеленый) круг показывает, что происходит, когда вы не обрезаете Artist. Он простирается за пределы осей (но не за пределы фигуры, т. Е. Размер фигуры не регулируется автоматически для построения графика всех ваших художников).
Единицы для x, y и радиуса соответствуют единицам данных по умолчанию. В этом случае я ничего не рисовал на своих осях ( fig.gca()возвращает текущие оси), и, так как ограничения никогда не устанавливались, по умолчанию они находятся в диапазоне от x до y от 0 до 1.
Вот продолжение примера, показывающее, как важны единицы измерения:
circle1 = plt.Circle((0, 0), 2, color='r')
# now make a circle with no fill, which is good for hi-lighting key results
circle2 = plt.Circle((5, 5), 0.5, color='b', fill=False)
circle3 = plt.Circle((10, 10), 2, color='g', clip_on=False)
ax = plt.gca()
ax.cla() # clear things for fresh plot
# change default range so that new circles will work
ax.set_xlim((0, 10))
ax.set_ylim((0, 10))
# some data
ax.plot(range(11), 'o', color='black')
# key data point that we are encircling
ax.plot((5), (5), 'o', color='y')
ax.add_artist(circle1)
ax.add_artist(circle2)
ax.add_artist(circle3)
fig.savefig('plotcircles2.png')
что приводит к:

Вы можете видеть, как я установил заливку 2-го круга False, что полезно для обобщения ключевых результатов (например, моей желтой точки данных).