Если вы используете bash, то история терминала сохраняется в файле с именем .bash_history. Удалите его, и история исчезнет.
Однако для MySQL лучше не вводить пароль в командной строке. Если вы просто укажете опцию -p без значения, вам будет предложено ввести пароль, и он не будет зарегистрирован.
Другой вариант, если вы не хотите каждый раз вводить пароль, это сохранить его в файле my.cnf. Создайте файл с именем ~ / .my.cnf примерно так:
[client]
user = <username>
password = <password>
Обязательно измените права доступа к файлу, чтобы только вы могли прочитать файл.
Конечно, таким образом ваш пароль все еще сохраняется в текстовом файле в вашем домашнем каталоге, так же, как он был ранее сохранен в .bash_history.