Эти пользователи хотят отвлекаться, когда приходит новое сообщение.
Похоже, вы пишете приложение для внутреннего проекта компании.
Возможно, вы захотите написать небольшое приложение для Windows в .net, которое добавляет значок уведомления, а затем может создавать необычные всплывающие окна, всплывающие окна или что-то еще, когда они получают новые сообщения.
Это не слишком сложно, и я уверен, что если вы спросите ТАК: «Как мне показать значок в трее» и «как мне сделать всплывающие уведомления», вы получите отличные ответы :-)
Для записи, я почти уверен, что (кроме использования диалогового окна с предупреждением / приглашением) вы не можете прошить панель задач в JS, поскольку это сильно зависит от Windows, а JS действительно так не работает. Вы можете использовать некоторые элементы управления ActiveX для Windows, специфичные для IE, но тогда вы навязываете IE своим бедным пользователям. Не делай этого :-(