Как запустить .ipynb Jupyter Notebook с терминала?

У меня есть некоторый код в файле .ipynb, и я пришел к тому, что мне действительно не нужна «интерактивная» функция IPython Notebook. Я хотел бы просто запустить его прямо из командной строки Mac Terminal.

По сути, если бы это был просто файл .py, я думаю, что я мог бы просто сделать python filename.py из командной строки. Есть ли что-то похожее для файла .ipynb?

Из командной строки вы можете преобразовать ноутбук в python с помощью этой команды:

jupyter nbconvert --to python nb.ipynb

https://github.com/jupyter/nbconvert

Возможно, вам придется установить пакет Python Mistune :

sudo pip install -U mistune

nbconvert позволяет запускать блокноты с --executeфлагом:

jupyter nbconvert --execute <notebook>

Если вы хотите запустить блокнот и создать новый блокнот, вы можете добавить --to notebook:

jupyter nbconvert --execute --to notebook <notebook>

Или, если вы хотите заменить существующий ноутбук новым выходом:

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace <notebook>

Поскольку это действительно длинная команда, вы можете использовать псевдоним:

alias nbx="jupyter nbconvert --execute --to notebook"
nbx [--inplace] <notebook>

Вы можете экспортировать весь свой код .ipynbи сохранить его как .pyскрипт. Затем вы можете запустить скрипт в вашем терминале.

Надеюсь, поможет.

В вашем терминале запустите ipython:

ipython

затем найдите свой скрипт и поместите туда:

%run your_script.ipynb

Для новой версии вместо:

ipython nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb

Вы можете использовать jupyter вместо ipython:

jupyter nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb

Обновление с цитируемым комментарием автора для лучшей видимости:

Примечание автора: «Этот проект начался до API выполнения Jupyter, который теперь является рекомендуемым способом запуска записных книжек из командной строки. Считайте, что runipy устарел и не поддерживается». - Себастьян Пальма

Установите библиотеку runipy, которая позволяет запускать ваш код на терминале

pip install runipy

После просто компиляции вашего кода:

runipy <YourNotebookName>.ipynb

Вы также можете попробовать cronjob. Вся информация здесь

В моем случае команда, которая больше всего подходила мне, была:

jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb

Зачем? Эта команда не создает дополнительные файлы (как .pyфайл), и выходные данные ячеек перезаписываются при каждом выполнении записной книжки.

Если вы запускаете:

jupyter nbconvert --help

--clear-output Очистить вывод текущего файла и сохранить на месте, перезаписав существующий блокнот.

Вы также можете использовать boarпакет для запуска вашей записной книжки в коде Python.

from boar.running import run_notebook

outputs = run_notebook("nb.ipynb")

Если вы обновите свой блокнот, вам больше не придется конвертировать его в файл Python.

Больше информации на:

https://github.com/alexandreCameron/boar/blob/master/USAGE.md

Из терминала беги

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace --allow-errors --ExecutePreprocessor.timeout=-1 my_nb.ipynb

Время ожидания по умолчанию составляет 30 секунд. -1 снимает ограничение.

Если вы хотите сохранить записную книжку в новую записную книжку, вы можете использовать флаг --output my_new_nb.ipynb

У меня была такая же проблема, и я нашел бумажную фабрику . Преимущество перед другими решениями заключается в том, что вы можете видеть результаты во время работы ноутбука. Я нахожу эту функцию интересной, когда ноутбук занимает много времени. Он очень прост в использовании:

pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb

Он также имеет другие удобные опции, такие как сохранение выходного файла в Amazon S3, Google Cloud и т. Д. См. Страницу для получения дополнительной информации.