Ответы:
В Visual Studio 2015/2017/2019:
Для VS2013 v4 + и VS2015
Нажмите «Настройки» (в главном меню проекта или в верхнем раскрывающемся меню), затем выберите «Настройки Git». Вы увидите глобальную настройку «Местоположение репозитория по умолчанию» (то, что вы хотите). Измените его и нажмите Обновить.