Отбросьте строки со всеми нулями в кадре данных pandas


108

Я могу использовать pandas dropna()функцию для удаления строк с некоторыми или всеми столбцами, установленными как NA's. Есть ли эквивалентная функция для удаления строк со всеми столбцами, имеющими значение 0?

P   kt  b   tt  mky depth
1   0   0   0   0   0
2   0   0   0   0   0
3   0   0   0   0   0
4   0   0   0   0   0
5   1.1 3   4.5 2.3 9.0

В этом примере мы хотели бы удалить первые 4 строки из фрейма данных.

Благодарность!


Чтобы уточнить, это два вопроса. Первый - удалить столбцы со всеми значениями, равными 0. Но также и для функции, эквивалентной dropna (), которая удалит столбцы с любым значением, равным 0.
алхимия

Ответы:


117

Оказывается, это можно красиво выразить в векторизованном виде:

> df = pd.DataFrame({'a':[0,0,1,1], 'b':[0,1,0,1]})
> df = df[(df.T != 0).any()]
> df
   a  b
1  0  1
2  1  0
3  1  1

7
Хорошо, но я думаю, что вы можете избежать отрицания с помощьюdf = df[(df.T != 0).any()]
Akavall

1
@Akavall Намного лучше!
U2EF1

1
Просто примечание: OP хотел отказаться rows with all columns having value 0, но можно вывести allметод.
paulochf

1
Все эти ответы объясняют, как мы можем отбрасывать строки со всеми нулями, однако я хотел удалить строки с 0 в первом столбце. С помощью всех обсуждений и ответов в этом посте я сделал это, выполнив df.loc [df.iloc [:, 0]! = 0]. Просто хотел поделиться, потому что эта проблема связана с этим вопросом !!
Hemanta

2
Транспонирование не требуется, any () может принимать ось в качестве параметра. Итак, это работает: df = df [df.any (axis = 1)]
Рахул Джа

134

Один лайнер. Транспонирование не требуется:

df.loc[~(df==0).all(axis=1)]

А для любителей симметрии это тоже работает ...

df.loc[(df!=0).any(axis=1)]

1
Для краткости (и, на мой взгляд, ясность цели) совместить это и комментарий Akavall в: df.loc[(df != 0).any(1)]. Командная работа!
Дэн Аллан,

1
+1, на 30% быстрее, чем транспонирование - от 491 до 614 мкс, и мне нравится, что axis=1он ясен; на мой взгляд, более
питонический

Следует упомянуть разницу между использованием .all и .any, поскольку в исходном вопросе упоминалась эквивалентность dropna. Если вы хотите удалить все строки с любым столбцом, содержащим ноль, вам нужно поменять местами .all и .any в приведенном выше ответе. Мне потребовалось некоторое время, чтобы осознать это, поскольку я искал эту функциональность.
Zak Keirn 06

Это не работает для меня, но возвращает мне то же самоеdf
Robvh

Есть ли «внутренняя» версия этого? Я вижу, что для удаления строк в df в соответствии с запросом OP это должно быть, df = df.loc[(df!=0).all(axis=1)]а df = df.loc[(df!=0).any(axis=1)]также удаление строк с любыми нулями, что было бы фактическим эквивалентом dropna ().
алхимия

20

Я просматриваю этот вопрос примерно раз в месяц и всегда должен найти лучший ответ из комментариев:

df.loc[(df!=0).any(1)]

Спасибо, Дэн Аллан!


2
Копать не нужно. @ 8one6 включил это в свой ответ еще в 2014 году, часть, в которой говорится: «А для тех, кто любит симметрию ...».
Рахул Мурмурия

16

Замените нули на, nanа затем отбросьте строки со всеми записями как nan. После этого замените nanнулями.

import numpy as np
df = df.replace(0, np.nan)
df = df.dropna(how='all', axis=0)
df = df.replace(np.nan, 0)

5
Это не удастся, если у вас есть какие-либо ранее существовавшие NaN в данных.
OmerB


7

При поиске я нашел несколько полезных решений, особенно для больших наборов данных:

df[(df.sum(axis=1) != 0)]       # 30% faster 
df[df.values.sum(axis=1) != 0]  # 3X faster 

Продолжая пример из @ U2EF1:

In [88]: df = pd.DataFrame({'a':[0,0,1,1], 'b':[0,1,0,1]})

In [91]: %timeit df[(df.T != 0).any()]
1000 loops, best of 3: 686 µs per loop

In [92]: df[(df.sum(axis=1) != 0)]
Out[92]: 
   a  b
1  0  1
2  1  0
3  1  1

In [95]: %timeit df[(df.sum(axis=1) != 0)]
1000 loops, best of 3: 495 µs per loop

In [96]: %timeit df[df.values.sum(axis=1) != 0]
1000 loops, best of 3: 217 µs per loop

В большем наборе данных:

In [119]: bdf = pd.DataFrame(np.random.randint(0,2,size=(10000,4)))

In [120]: %timeit bdf[(bdf.T != 0).any()]
1000 loops, best of 3: 1.63 ms per loop

In [121]: %timeit bdf[(bdf.sum(axis=1) != 0)]
1000 loops, best of 3: 1.09 ms per loop

In [122]: %timeit bdf[bdf.values.sum(axis=1) != 0]
1000 loops, best of 3: 517 µs per loop

Бывают ли что-то плохие, если ваша строка содержит -1 и 1?
Рис Улерих

Конечно, эта сумма не сработала бы, если бы у вас были равные строки в сумме до 0. Вот быстрый обходной путь для того, что немного медленнее: df[~(df.values.prod(axis=1) == 0) | ~(df.values.sum(axis=1)==0)]
clocker

Функция prod () ничего не решает. Если у вас есть 0 в строке, которая вернет 0. Если вам нужно обработать такую ​​строку: [-1, -0,5, 0, 0,5, 1], ни одно из ваших решений не будет работать.
Рахул Мурмурия

Вот правильная версия, которая работает в 3 раза быстрее, чем принятый ответ:bdf[np.square(bdf.values).sum(axis=1) != 0]
Рахул Мурмурия

5
import pandas as pd

df = pd.DataFrame({'a' : [0,0,1], 'b' : [0,0,-1]})

temp = df.abs().sum(axis=1) == 0      
df = df.drop(temp)

Результат:

>>> df
   a  b
2  1 -1

Не сработало для меня с фреймом данных с 1 столбцом. GotValueError: labels [True ... ] not contained in matrix
The Unfun Cat

вместо df = df.drop(temp)использованияdf = df.drop(df[temp].index)
Дуглас Феррейра

3

Вы можете использовать быструю lambdaфункцию, чтобы проверить все ли значения в данной строке 0. Затем вы можете использовать результат применения lambdaкак способ выбора только тех строк, которые соответствуют или не соответствуют этому условию:

import pandas as pd
import numpy as np

np.random.seed(0)

df = pd.DataFrame(np.random.randn(5,3), 
                  index=['one', 'two', 'three', 'four', 'five'],
                  columns=list('abc'))

df.loc[['one', 'three']] = 0

print df
print df.loc[~df.apply(lambda row: (row==0).all(), axis=1)]

Урожайность:

              a         b         c
one    0.000000  0.000000  0.000000
two    2.240893  1.867558 -0.977278
three  0.000000  0.000000  0.000000
four   0.410599  0.144044  1.454274
five   0.761038  0.121675  0.443863

[5 rows x 3 columns]
             a         b         c
two   2.240893  1.867558 -0.977278
four  0.410599  0.144044  1.454274
five  0.761038  0.121675  0.443863

[3 rows x 3 columns]

1

Другая альтернатива:

# Is there anything in this row non-zero?
# df != 0 --> which entries are non-zero? T/F
# (df != 0).any(axis=1) --> are there 'any' entries non-zero row-wise? T/F of rows that return true to this statement.
# df.loc[all_zero_mask,:] --> mask your rows to only show the rows which contained a non-zero entry.
# df.shape to confirm a subset.

all_zero_mask=(df != 0).any(axis=1) # Is there anything in this row non-zero?
df.loc[all_zero_mask,:].shape


0

Для меня этот код: df.loc[(df!=0).any(axis=0)] не работал. Он вернул точный набор данных.

Вместо этого я использовал df.loc[:, (df!=0).any(axis=0)] и удалил все столбцы с 0 значениями в наборе данных.

Функция .all()удалила все столбцы, в которых есть любые нулевые значения в моем наборе данных.



-2

Чтобы удалить все столбцы со значениями 0 в любой строке:

new_df = df[df.loc[:]!=0].dropna()
Используя наш сайт, вы подтверждаете, что прочитали и поняли нашу Политику в отношении файлов cookie и Политику конфиденциальности.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.