Ошибка pydot и graphviz: не удалось импортировать dot_parser, загрузка файлов точек будет невозможна

Когда я запускаю очень простой код с помощью pydot

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

Он выводит мне сообщение об ошибке:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

Я использую python 2.7.3

Ответ для pydot >= 1.1:

Несовместимость (восходящего потока) pydotбыла исправлена 6dff94b3f1 , и поэтому pydot >= 1.1будет совместим сpyparsing >= 1.5.7 .

Ответ применим к pydot <= 1.0.28:

Для всех, кто сталкивается с этим, это связано с изменениями в pyparsing с версии 1.x до версии 2.x. Чтобы установить pydot с помощью pip, сначала установите старую версию pyparsing:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

Если вы не устанавливали pyparsingusing pip, а использовали вместо этого setup.py, ознакомьтесь с этим решением, чтобы удалить пакет. Спасибо @qtips.

В репозитории pip есть новый пакет под названием pydot2, который правильно работает с pyparsing2. Я не мог понизить версию своих пакетов, потому что matplotlib зависит от нового пакета pyparsing.

Примечание: python2.7 из macports

pydot использовал частную переменную модуля (_noncomma) из pyparsing. Приведенный ниже diff исправляет его для использования для pyparsing 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

Я разветвил репозиторий pydot [1], применил патч Gabi Davar и некоторые изменения для поддержки python-3. Пакет доступен в PyPI [2].

Ура

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

См. Следующую ссылку: http://infidea.net/troubleshooting-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Решением было не устанавливать pydot откуда-то, а «python-pydot» из официальных репозиториев ubuntu.

Сейчас есть как минимум еще две версии, которые поддерживают PyParsing-2 и Python-3:

• PyDotPlus от Карлоса Дженкинса с хорошим сборщиком travis и красивой документацией . Однако вам нужно будет изменить имя папки с site-packages\pydotplusна, site-packages\pydotчтобы он работал с существующими программами, импортирующими pydot.
• pydot3k пользователя bmcorser . К сожалению, не вышло!
• prologic / pydot от Джеймса Миллса, на которую ссылается официальная кодовая страница Google pydot как ...

  ветка для совместимости с Python 3

• и вот рабочая ссылка на pydot2 Дэвида Виллы, которая отлично работает: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

У меня снова возникла проблема, и мое вышеупомянутое решение не сработало. Если это верно для вас, и вы также используете Anaconda на Mac с El Capitan, попробуйте следующее:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

Что я сделал в конце после стольких попыток из того, что я видел здесь (псевдопоследовательность для работы с networkx):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

Это сработало для меня (Mac OS X 10.9 с Python 2.7.10 на Anaconda):

conda uninstall pydot

Затем,

conda install pydot

Затем Pyparsing понижается (с 2.x до 1.5.7) после установки pydot. Будущие гуглеры: это позволило мне правильно установить и импортировать Theano.

На OSX Mavericks сработало следующее ... Я получил ту же ошибку, но внизу также была жалоба на отсутствие исполняемого файла graphviz ... Я думаю, проблема заключалась в том, что я установил graphviz до других модулей?

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

Когда другие решения не работают, это быстрый и грязный метод решения проблемы:

Этот пример взят из python 2.7 на Ubuntu 16.04.

Отредактируйте файл python2.7 / site-packages / keras / utils / visualize_util.py и прокомментируйте фрагмент кода ниже.

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz () избыточен в новых версиях pydot, и вышеуказанный вызов не работает.

Я также столкнулся с проблемой и моим pydot == 1.0.28 во время pyparsing == 2.2.0. Я исправил проблему, загрузив новейшую версию pydot 1.2.3 (tar.gz) из Google, а затем установив ее в автономном режиме. Когда я обновил pydot в ubuntu 14.04, он сказал, что pydot 1.0.28 - самая новая версия. Поэтому качаю с гугла версию 1.2.3.

Вам нужно понизить версию pyparsing с версии 2.x до версии 1.5.7, чтобы pydot работал правильно.

Для win-64 с использованием Conda это сработало для меня:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

Затем я отключил / удалил версию 2.x и перезагрузил pyparsing в свой скрипт:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

Чтобы проверить, установлена ​​ли у вас правильная версия:

print pyparsing.__version__