Нет, спецификации метаданных GeoJSON нет.
Определенно не помещайте метаданные в объект свойств, как предполагает @RK.
Я бы предложил, как и @albert, использовать JSON-LD. Вы можете добавить метаданные Dublin Core в коллекцию объектов следующим образом:
{ "@context": {
"description": "http://purl.org/dc/terms/description",
... },
"type": "FeatureCollection",
"description": "My features",
... }
(См. Также https://github.com/geojson/geojson-ld/blob/master/contexts/geojson-dcterms.jsonld )
Если вы хотите продолжать использовать метаданные FGDC, вы можете добавить ссылку на документ метаданных в свой JSON.
{ "type": "FeatureCollection",
"fgdc": "http://example.com/metadata.xml",
... }
Просто убедитесь, что вы объясняете другим (возможно, используя JSON-LD) смысл этого элемента "fgdc".