Получить значение пикселя растра GDAL под точкой OGR без NumPy?

Я работаю над вычислительной моделью обилия диких опылителей в ландшафте. Сама модель завершена, и сейчас я борюсь с этапом постобработки.

У меня есть мой растровый растр GDAL, который выглядит примерно так (более светлые цвета означают большее посещение опылителя на пиксель):

И у меня есть шейп-файл OGR точек, представляющих образцы мест на ландшафте:

Я пытаюсь провести некоторый анализ пикселей под этими точками, но для этого мне нужно иметь возможность извлечь значение пикселя под точкой.

Можно ли извлечь значение пикселя под точкой, используя только OGR и GDAL через Python? Я бы предпочел не читать весь растр в память ReadAsArray(), так как мои выходные растры очень, очень большие (слишком большие, чтобы поместиться в память).

Я заметил этот пост , который похож, но требует вызова из командной строки.

Вы можете использовать метод gdal.Dataset или gdal.Band ReadRaster. См. Учебники по GDAL и OGR API и пример ниже. ReadRaster не использует / требует numpy, возвращаемое значение является необработанными двоичными данными и должно быть распаковано с использованием стандартного модуля структуры python .

Пример:

from osgeo import gdal,ogr
import struct

src_filename = '/tmp/test.tif'
shp_filename = '/tmp/test.shp'

src_ds=gdal.Open(src_filename) 
gt=src_ds.GetGeoTransform()
rb=src_ds.GetRasterBand(1)

ds=ogr.Open(shp_filename)
lyr=ds.GetLayer()
for feat in lyr:
    geom = feat.GetGeometryRef()
    mx,my=geom.GetX(), geom.GetY()  #coord in map units

    #Convert from map to pixel coordinates.
    #Only works for geotransforms with no rotation.
    px = int((mx - gt[0]) / gt[1]) #x pixel
    py = int((my - gt[3]) / gt[5]) #y pixel

    structval=rb.ReadRaster(px,py,1,1,buf_type=gdal.GDT_UInt16) #Assumes 16 bit int aka 'short'
    intval = struct.unpack('h' , structval) #use the 'short' format code (2 bytes) not int (4 bytes)

    print intval[0] #intval is a tuple, length=1 as we only asked for 1 pixel value

В качестве альтернативы, поскольку причина, по которой вы отказались от использования, numpyзаключалась в том, чтобы не читать весь используемый массив ReadAsArray(), ниже приведен пример, в котором используется numpyи не читается весь растр.

from osgeo import gdal,ogr
import struct

src_filename = '/tmp/test.tif'
shp_filename = '/tmp/test.shp'

src_ds=gdal.Open(src_filename) 
gt=src_ds.GetGeoTransform()
rb=src_ds.GetRasterBand(1)

ds=ogr.Open(shp_filename)
lyr=ds.GetLayer()
for feat in lyr:
    geom = feat.GetGeometryRef()
    mx,my=geom.GetX(), geom.GetY()  #coord in map units

    #Convert from map to pixel coordinates.
    #Only works for geotransforms with no rotation.
    px = int((mx - gt[0]) / gt[1]) #x pixel
    py = int((my - gt[3]) / gt[5]) #y pixel

    intval=rb.ReadAsArray(px,py,1,1)
    print intval[0] #intval is a numpy array, length=1 as we only asked for 1 pixel value