В QGIS 2.x никогда не было возможности экспортировать в виде многослойного PDF. Вместо этого был обременительный обходной путь, включающий экспорт в виде SVG, импорт в Scribus и ручное добавление отдельных функций в отдельные слои. Все, что рассматривается в этом вопросе: может ли QGIS сохранять слои при экспорте в PDF?
Есть ли более эффективный способ создания многоуровневого PDF в QGIS 3.0?