Я установил QGIS 2.16 и заметил, что слияние (Векторное меню> Управление данными), похоже, больше не имеет опции папки. Это был вариант, который позволял вам обрабатывать / объединять целую папку, не загружая слои в ваш проект / рабочую область. Я посмотрел журнал изменений для QGIS 2.16 - хотя fTools были заменены инструментами обработки, я не могу понять, почему были удалены дополнительные функции.