Ответы:
Согласно AN70707 Page 16:
Полярность можно поменять на дифференциальных парах USB 3.0. Определение полярности автоматически выполняется PHY USB 3.0 во время обучения канала, как это определено в разделе 6.4.2 спецификации USB3.0, и не требует каких-либо дополнительных изменений в прошивке устройства. Учитывая разводку различных разъемов USB, можно использовать механизм инверсии полярности, чтобы гарантировать, что следы USB не пересекаются друг с другом.