На самом деле Eagle имеет обе эти функции начиная с версии 6. С их сайта:
Воспользуйтесь дифференциальной парной маршрутизацией и автоматическими меандрами
Специальные сигналы могут быть направлены с одинаковой длиной. Дифференциальная парная маршрутизация используется для пар дифференциальных (равных и противоположных) сигналов через плату для создания сбалансированной системы передачи. Создание меандров помогает пользователям автоматически подавать сигнал определенной длины в печатной плате. Меандры в трассах используются для увеличения времени задержки в высокоскоростных цифровых цепях.
http://www.cadsoftusa.com/eagle-pcb-design-software/new-in-v6/?language=en (на полпути вниз)
Посмотреть на себя.
Кнопка Меандр:
Соответствие длины дифференциальной пары (из руководства):
Я на самом деле не знаю, как реализовать эти методы, но я могу указать вам на документацию. Проверьте руководство (предупреждение 300+ на странице PDF) на стр. 175–178 - http://www.cadsoft.de/wp-content/uploads/2011/05/V6_manual_en.pdf.