Что вам нужно сделать, это просто удалить смещение постоянного тока все вместе, а не поставить отрицательный. Это известно как связь переменного тока. Если вы пропустите выход вашего генератора прямоугольных импульсов через последовательный конденсатор, он должен делать то, что вам нужно. Это, однако, будет за счет уменьшения прямоугольной волны.
Пример схемы показан ниже для вас:
И выход будет выглядеть следующим образом (зеленая трассировка = выход генератора, синяя трассировка = напряжение на резисторе):
Вероятно, вы получите небольшую потерю напряжения (то есть ваши пики будут чуть меньше +/- 2,5 В), поскольку ни один конденсатор не идеален, но вы можете получить довольно хороший прямоугольный выходной сигнал, если вы получите конденсатор правильного значения. Вам придется экспериментировать и посмотреть. Обычно, чем больше значение конденсатора, которое вы выбираете, тем ближе будет выходной сигнал к исходному для любой частоты, которую выдает настольный генератор прямоугольных сигналов.