Ошибка
Попытка удалить кортежи, содержащие недопустимые метки времени с
DELETE FROM comments WHERE date > '1 Jan 9999' OR date < '1 Jan 2000' OR date_found > '1 Jan 9999' OR date_found < '1 Jan 2000';
заканчивается в
ERROR: attempted to delete invisible tuple
Существует список рассылки 2009 года, в котором обсуждается точно такое же сообщение об ошибке, где OP исправил его, но я не вижу объяснения того, как он это сделал или что могло привести к этой ошибке.
Я беспомощен из-за отсутствия хитов в Google и из-за моего ограниченного знания PostgreSQL.
Что привело к коррупции
У меня был сервер PostgreSQL 9.5.5 ( данные ~ 4 ТБ, все настройки по умолчанию, за исключением увеличенного объема памяти ), работающий в Debian 8, когда ядро ОС запаниковало - возможно, при перекомпоновке / dev / md1, где находился swap. До этого PostgreSQL израсходовал почти все дисковое пространство с файлом журнала 400 ГБ. ОС никогда больше не загружалась, проверки диска были в порядке, поэтому я загрузился с LiveCD и на всякий случай сделал резервную копию каждого блочного устройства для образов. Я успешно перестроил каталог / из / dev / md2, fsck показал чистую файловую систему, и я сделал резервную копию папки PGDATA на внешнем жестком диске.
Что я сделал, чтобы попытаться восстановить
После того, как я отформатировал устройства md и переустановил ОС вместе со свежим postgresql-9.5, я остановил сервер PostgreSQL, переместил и сжал папку PGDATA для пользователя postgres и запустил сервер - все было хорошо, ошибок не было.
Как только я начал pg_dumpall
, он умер с
Error message from server: ERROR: timestamp out of range
Естественно, я пытался удалить обидные кортежи, только чтобы invisible tuple
снова и снова сталкиваться с одной и той же ошибкой.
Вещи, которые я пытался
Прежде всего, DELETE запросы не выполнялись из-за поврежденных страниц, поэтому я установил следующие настройки:
zero_damaged_pages = on
ignore_system_indexes = on
enable_indexscan = off
enable_bitmapscan = off
enable_indexonlyscan = off
Теперь я заметил, что когда я снова запускаю одни и те же запросы, сервер снова и снова обнуляет одни и те же страницы, не зная, что это значит:
invalid page in block 92800 of relation base/16385/16443; zeroing out page
Я пробовал следовать в неопределенном порядке:
pg_resetxlog -D $PGDATA
сделал свою работу без каких-либо ошибок или сообщений- Удалил все индексы, включая ограничения pkey
CREATE TABLE aaa AS (SELECT * FROM comments);
приводит кSegmentation fault
поheap_deform_tuple (tuple=tuple@entry=0x7f0d1be29b08, tupleDesc=tupleDesc@entry=0x7f0d1a35abe0, values=values@entry=0x7ffd57a5beb0, isnull=isnull@entry=0x7ffd57a65af0 "\001\001")
Он воспроизводим и оставляет дамп ядра ~ 9 ГБ.SELECT COUNT(*) from comments;
разрешеноVACUUM comments;
завершать, тот же трюк не работает на других таблицах.SELECT COUNT(*) from photos;
иVACUUM photos;
теперь умираетERROR: MultiXactId 302740528 has not been created yet -- apparent wraparound
- этот часто посещает каждую таблицу, где другие ошибки больше не появляются.
мысли
БД сталкивался с большим количеством ( возможно, повторяющихся ) записей сON CONFLICT
предложением,VACUUM
когда ББ делал панику в ядре, и я считаю, что это то, что от него осталось, вызывает проблемыnonexistent MultiXactIds
иinvisible tuple
- Данные собирались с помощью crawler в течение 2+ лет, и я полностью согласен с их потерей.
- Теперь я делаю резервные копии
- Не было никаких реляционных ограничений между таблицами или каких-либо триггеров
Вот вывод pg_controldata на данный момент:
pg_control version number: 942
Catalog version number: 201510051
Database system identifier: 6330224129664261958
Database cluster state: in production
pg_control last modified: Thu 08 Dec 2016 01:06:22 AM EET
Latest checkpoint location: 1562/8F9F8A8
Prior checkpoint location: 1562/8F7F460
Latest checkpoint's REDO location: 1562/8F9F8A8
Latest checkpoint's REDO WAL file: 000000010000156200000008
Latest checkpoint's TimeLineID: 1
Latest checkpoint's PrevTimeLineID: 1
Latest checkpoint's full_page_writes: on
Latest checkpoint's NextXID: 0/40781255
Latest checkpoint's NextOID: 67798231
Latest checkpoint's NextMultiXactId: 1
Latest checkpoint's NextMultiOffset: 0
Latest checkpoint's oldestXID: 615
Latest checkpoint's oldestXID's DB: 1
Latest checkpoint's oldestActiveXID: 0
Latest checkpoint's oldestMultiXid: 1
Latest checkpoint's oldestMulti's DB: 1
Latest checkpoint's oldestCommitTsXid:0
Latest checkpoint's newestCommitTsXid:0
Time of latest checkpoint: Thu 08 Dec 2016 01:06:22 AM EET
Fake LSN counter for unlogged rels: 0/1
Minimum recovery ending location: 0/0
Min recovery ending loc's timeline: 0
Backup start location: 0/0
Backup end location: 0/0
End-of-backup record required: no
wal_level setting: minimal
wal_log_hints setting: off
max_connections setting: 100
max_worker_processes setting: 8
max_prepared_xacts setting: 0
max_locks_per_xact setting: 64
track_commit_timestamp setting: off
Maximum data alignment: 8
Database block size: 8192
Blocks per segment of large relation: 131072
WAL block size: 8192
Bytes per WAL segment: 16777216
Maximum length of identifiers: 64
Maximum columns in an index: 32
Maximum size of a TOAST chunk: 1996
Size of a large-object chunk: 2048
Date/time type storage: 64-bit integers
Float4 argument passing: by value
Float8 argument passing: by value
Data page checksum version: 0
Обновления
- ( 9 декабря 2016 г. ) Читая о несуществующих MultiXactIds , я вспомнил, что в момент сбоя моя база данных не была загружена, но обрабатывал
VACUUM
запрос вручную . Я перевел веб-серверы и сканеры в автономный режим после того, как понял, что на дисках осталось только 3% пространства. Я должен был проверить/var/log
большие файлы, но я ошибочно обвинил PostgreSQL и попыталсяVACUUM FULL
, только чтобы найти его прерванным из-за небольшого свободного места на устройстве. Итак, я запустил обычный VACUUM и оставил все как есть. - ( 14 декабря 2016 г. ) Загрузил ветку 9.5 исходных текстов PostgreSQL с Github, закомментировал блоки в heapam.c и multixact.c и скомпилировал его с надеждой, что он не выдаст эти ошибки. Но сервер не запустился, потому что он должен был быть настроен с теми же флагами, которые использовались у меня из APT. Было около 47 флагов, каждый из которых требовал зависимости с неочевидным именем, поэтому я отказался от этой идеи.
( 16 декабря 2016 г. ) Я нашел способ избавиться от кортежей с неправильными временными метками, обнулив соответствующие страницы. Сначала я установил следующие параметры в
psql
:\set FETCH_COUNT 1 \pset pager off
Я тогда делаю
SELECT ctid, * FROM comments;
. Таким образом, он выплевываетctid
плохой кортеж до того, как запрос умирает. Затем я перехожу к заполнению этой страницы нулями:dd if=/dev/zero of=/var/lib/postgresql/9.5/main/base/16385/16443 bs=8K seek=92803 count=1 conv=notrunc
но каждая страница, обнуленная таким образом, разбивает предыдущую страницу, в результате чего страница16442
теперь имеет кортеж с недопустимой отметкой времени. Не уверен, что я здесь делаю не так.( 16 декабря 2016 г. ) Попытка
pg_dump -Fc --table photos vw > photos.bak
привести к ошибке сегментации после записи 1,3 ГБ ( из, вероятно, 800 ГБ ). Вот журнал сервера:2016-12-16 18:48:05 EET [19337-2] LOG: server process (PID 29088) was terminated by signal 11: Segmentation fault 2016-12-16 18:48:05 EET [19337-3] DETAIL: Failed process was running: COPY public.photos (id, owner_id, width, height, text, date, link, thumb, album_id, time_found, user_id, lat, long) TO stdout; 2016-12-16 18:48:05 EET [19337-4] LOG: terminating any other active server processes 2016-12-16 18:48:05 EET [19342-2] WARNING: terminating connection because of crash of another server process 2016-12-16 18:48:05 EET [19342-3] DETAIL: The postmaster has commanded this server process to roll back the current transaction and exit, because another server process exited abnormally and possibly corrupted shared memory. 2016-12-16 18:48:05 EET [19342-4] HINT: In a moment you should be able to reconnect to the database and repeat your command. 2016-12-16 18:48:05 EET [19337-5] LOG: all server processes terminated; reinitializing 2016-12-16 18:48:06 EET [29135-1] LOG: database system was interrupted; last known up at 2016-12-14 22:58:59 EET 2016-12-16 18:48:07 EET [29135-2] LOG: database system was not properly shut down; automatic recovery in progress 2016-12-16 18:48:07 EET [29135-3] LOG: invalid record length at 1562/A302F878 2016-12-16 18:48:07 EET [29135-4] LOG: redo is not required 2016-12-16 18:48:07 EET [29135-5] LOG: MultiXact member wraparound protections are now enabled 2016-12-16 18:48:07 EET [19337-6] LOG: database system is ready to accept connections 2016-12-16 18:48:07 EET [29139-1] LOG: autovacuum launcher started
Вот короткая трассировка стека:
#0 pglz_decompress (source=source@entry=0x7fbfb6b99b13 "32;00/0ag4d/Jnz\027QI\003Jh3A.jpg", slen=<optimized out>, dest=dest@entry=0x7fbf74a0b044 "", rawsize=926905132) #1 0x00007fc1bf120c12 in toast_decompress_datum (attr=0x7fbfb6b99b0b) #2 0x00007fc1bf423c83 in text_to_cstring (t=0x7fbfb6b99b0b)
Я понятия не имею, как обойти это.
( 29 декабря 2016 г. ) Я написал утилиту, которая
SELECT * FROM tablename LIMIT 10000 OFFSET 0
увеличивает инкремент смещения и сужает мертвые кортежи и успешно дублирует данные на моем локальном компьютере, за исключением кортежей ( надеюсь, единственных ), которые я испортил вручную. Также предполагается, что сервер перезапустится. Однако у меня не было достаточно места на моем RAID, и я создал табличное пространствоslowdisk
на жестком диске 8 ТБ. Когда я попытаюсьCREATE DATABASE vwslow WITH TABLESPACE slowdisk
, это не будет сделано с ошибками:2016-12-29 02:34:13 EET [29983-1] LOG: request to flush past end of generated WAL; request 950412DE/114D59, currpos 1562/A3030C70 2016-12-29 02:34:13 EET [29983-2] CONTEXT: writing block 58368001 of relation base/16385/16473 2016-12-29 02:34:13 EET [29983-3] ERROR: xlog flush request 950412DE/114D59 is not satisfied --- flushed only to 1562/A3030C70 2016-12-29 02:34:13 EET [29983-4] CONTEXT: writing block 58368001 of relation base/16385/16473 2016-12-29 02:34:13 EET [30005-44212] postgres@vw ERROR: checkpoint request failed 2016-12-29 02:34:13 EET [30005-44213] postgres@vw HINT: Consult recent messages in the server log for details. 2016-12-29 02:34:13 EET [30005-44214] postgres@vw STATEMENT: CREATE DATABASE vwslow WITH TABLESPACE slowdisk;
Руководство
CHECKPOINT
вылилось в те же ошибки.После перезапуска сервера ошибка контрольной точки исчезла, и я запустил свой инструмент. Ответит на мой вопрос и опубликует код, если он работает.