Вы должны быть в состоянии просто запустить mysql_install_db
из командной строки
mysql_install_db инициализирует каталог данных MySQL и создает системные таблицы, которые он содержит, если они не существуют. Он также инициализирует системное табличное пространство и связанные структуры данных, необходимые для управления таблицами InnoDB. Начиная с MySQL 5.6.8, mysql_install_db является сценарием Perl и может использоваться в любой системе с установленным Perl. До 5.6.8 это сценарий оболочки и доступен только на платформах Unix.
Пожалуйста, полностью прочитайте документацию по MySQLmysql_install_db
, а затем ...
ДАЙТЕ ЭТО ПОПРОБУЙТЕ !!!
Если это не работает с первой попытки, сделайте это
mkdir /var/lib/mysql
mkdir /var/lib/mysql/mysql
chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql
затем беги mysql_install_db
снова