Вы можете попробовать проверить вывод
$ pkgutil --pkgs
чтобы увидеть, если какое-либо из имен выглядит как пакет, который утверждает, что установлен, то
$ pkgutil --pkg-info thatpackage
чтобы увидеть, где это было установлено. Если его там нет, вы можете попробовать
$ sudo pkgutil --forget thatpackage
и посмотрим, позволит ли App Store перезагрузить вас; но в этот момент я бы, вероятно, сначала обратился в службу поддержки App Store, так как взлом базы данных пакета может вызвать большие проблемы (например, забывать, что вы когда-либо покупали программу - хотя я надеюсь, что программисты Apple умнее этого).