Если вам удобно работать с терминалом, rsync - отличная утилита, которая легко синхронизирует папки. Взгляните на учебник здесь (учебник находится на веб-сайте «Все Linux», но утилита rsync поставляется с Linux и Mac OS X).
Примеры команд:
Скопируйте / объедините все новое из SOURCE в DEST , ничего не удаляйте:
rsync -va /path/to/folder/SOURCE/ /path/to/folder/DEST/
Скопируйте все новое в DEST и удалите все элементы из DEST , которых нет в SOURCE :
rsync -va --delete /path/to/folder/SOURCE/ /path/to/folder/DEST/
Обязательно включайте косую черту /
в конце пути к папке.
Полезный совет здесь заключается в том, что вы можете перетаскивать папки в окно терминала, чтобы он вставлял полный путь к этой папке (или файлу), сохраняя при этом много печатания и опечаток.