Когда вы удаляете документ, система очищает все версии одновременно.
Я копировал этот документ в другом месте (другой диск), удалял тот, у которого была история, и затем копировал его обратно.
Кроме того, из приложения, если у вас есть опция «Дублировать» или «Экспорт» в меню «Файл», это приведет к появлению неверсированной копии, которую вы затем сможете сохранить.
На практике это никогда не было проблемой, поскольку, когда я перетаскиваю файл для экспорта или выгрузки, эти версии Lion не перемещаются вместе с документом - они занимают только минимальное пространство на моем HD и помогают мне с историей каждого документа.