Стандартные места установки для git-репозиториев (например, jQuery)

Я нашел несколько разных ответов, и мне было любопытно, есть ли какой-то стандарт между ними в папке в $ HOME или чем-то вроде / var?

Не стандартно, но если репозиторий, то он доступен только для записи вами, поэтому в $ HOME

Если он находится на сервере и не имеет доступа, кроме как по протоколам http или git, то в любом месте (и некоторые настройки могут использовать var, я бы использовал / git)