Ответы:
Если магазин приложений не знает об обновлениях, он не сможет уведомить вас - поэтому в Системных настройках перейдите на панель настроек «Магазин приложений» и отключите опцию автоматического поиска обновлений.
В OSX Mavericks :
Вы можете временно отключить уведомления, прокрутив вниз на панели уведомлений и включив параметр «Не беспокоить». Насколько я понимаю, продолжительность действия этого параметра определяется вашими настройками в Системных настройках> Уведомления> Не беспокоить> От XXX до XXX.