Этот битрейт довольно низкий, что может объяснить блочность (это слово?).
Из правил загрузки YouTube вы кодируете на минимальном рекомендуемом битрейте для стандартного видео 720P. Может быть, вы должны повысить до 7500K (7,5 Мбит / с) и посмотреть, поможет ли это.
Кроме того, похоже, что Octopi просто вызывает ffmpeg локально и возвращает видео. Используемая кодировка может привести к блочности. Если у вас есть доступ к необработанным фотографиям, вы можете просто скопировать их в каталог на другом компьютере и сгенерировать видео, используя видеокодек с меньшими потерями. Конечно, это будет работать только в том случае, если вы делаете качественные фотографии. Предполагая, что они есть, вот хороший ресурс для производства видео из последовательностей изображений в ffmpeg.
Удачи!
PS В качестве альтернативы, если вы предпочитаете легкий видео инструмент с графическим интерфейсом, вы можете использовать ImageJ .